L'aeroporto principale della Lituania, situato a 7 km a sud del centro di Vilnius, serve principalmente voli verso l'Europa occidentale e meridionale e la Scandinavia. Non ci sono voli diretti a lungo raggio per Vilnius.

Poiché la Lituania non ha una propria compagnia aerea nazionale, la maggior parte dei voli è operata da Wizz Air e Ryanair.

Anche la compagnia aerea lettone Air Baltic gestisce uno dei suoi hub a Vilnius, volando verso i paesi confinanti, offrendo voli stagionali verso l’Europa meridionale e operando rotte verso i principali aeroporti europei.

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Quando si viaggia in Lituania, molti viaggiatori combinano l'aeroporto di Vilnius con quello di Kaunas ( KUN), a 100 km di distanza, servito da un gran numero di voli Ryanair.