L'aeroporto di Skopje utilizza un terminal comune a tutti i voli. L'edificio è molto piccolo ma ben progettato. Dopo i controlli di sicurezza, ci si aspetta una carenza di posti a sedere quando partono più aerei contemporaneamente.
L'orientamento è facile e le distanze all'interno del terminal sono molto brevi.
Il controllo passaporti all'arrivo è efficiente e i tempi di attesa tendono a essere compresi tra i 10 e i 20 minuti.
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Trasferimento tra i voli
Skopje non è un aeroporto tipico per i trasferimenti. La maggior parte dei trasferimenti non sono garantiti, ovvero i viaggiatori creano il proprio trasferimento da due biglietti indipendenti.
Anche se non avete un bagaglio registrato, all'arrivo dovete sempre passare il controllo passaporti, uscire e passare di nuovo il controllo passaporti e sicurezza fino all'area di transito.
Di solito l'intera procedura dura dai 20 ai 40 minuti.